ImageJ培训

第一天：ImageJ基础与图像处理入门

1. 培训导入与软件简介

· 培训目标与内容结构

· ImageJ/Fiji 简史、功能定位和应用领域

· 不同版本（ImageJ、Fiji）比较与选择

2. 软件安装与界面基础

· ImageJ/Fiji 安装和启动

· 主界面元素与常用工作区介绍

· 文件类型支持与数据管理（单张、多张、堆叠、时间序列）

3. 图像导入与基本操作

· 图片的打开、保存与格式转换

· 图像显示方式与颜色空间基础

· 图像基本属性查看（尺寸、分辨率、灰度/彩色等）

4. 图像预处理常用工具

· 剪切、缩放、旋转、镜像、翻转等基本操作

· 图像增强（亮度、对比度、伽马、滤波）

· 去噪、锐化等预处理操作方法

5. 区域选择与测量基础

· 各种选择工具（矩形、椭圆、自由、多边形等）

· 区域测量（长度、面积、周长、信号强度等）

· 设置测量参数与结果统计导出

6. 基础操作实训与答疑

· 典型显微镜/医学图像导入与基础处理

· 拆解与答疑交流

第二天：批量分析、自动化与插件扩展应用

1. 批量处理与自动化分析

· 批量图像处理基础流程（宏与批处理功能）

· 批处理参数化与结果导出

· 宏录制与简单脚本编辑（自动分割、测量、文件导出）

2. 图像分割与目标识别

· 阈值分割、自动分割方法比较

· 粒子分析与特征提取（细胞/颗粒计数、面积分布等）

· 轮廓提取与对象追踪

3. 图像校正与定量分析

· 图像配准（注册）、拼接等工具应用

· 校正与标尺设置（物理长度/像素的转换）

· 多通道分析（荧光、RGB合成等）

4. 高级插件与扩展工具

· 插件安装与管理（Fiji插件库介绍）

· 常用插件讲解（如Cell Counter, Bio-Formats, 3D Viewer, TrackMate等）

· 与第三方软件/数据库的数据互通基础

5. 综合实操案例

· 综合案例：如细胞计数、组织切片分析、荧光强度定量等

· 数据汇总与结果导出（图表、Excel、图片报告）